2016-2017 Sezonunda Bölgesel Amatör Lig'den Spor Toto 3. Lig'e yükselen 2 takım daha belli oldu. 30 Nisan 2017 tarihinde İstanbul'da oynanan maçta Modafenspor'u 2-1 yenen Erokspor ile Konya'da oynanan Yeni Altındağ Belediye Spor - Bucak Belediye Oğuzhan Spor 2. Kademe play-off müsabakasında 2-0 galip gelen Yeni Altındağ Belediye Spor, Spor Toto 3. Lig'e yükselme başarısı gösterdi.
Erzurum Kazım Karabekir Stadı'nda 30 Nisan 2017 tarihinde Mardin 47 Spor ile Arsinspor arasında oynanan play-off müsabakasının normal süresi 1-1 berabere biterken, müsabakanın uzatma sürelerinde de beraberlik bozulmayınca penaltı atışlarına geçildi. Penaltı atışlarında çıkan olaylar nedeniyle hakem müsabakayı tatil etti. Müsabaka hakkında TFF Yönetim Kurulu karar verecek.
Verilen kararda Mardin 47 Spor olaylarla hiçbir alakasının olmadığını ve haklı bulunarak TFF N-Mardin 47 Spor’un 3. Lige çıkması kararı verdi.
